Vilkaviškio vyskupijos jaunimo centro vykdomi projketai: Ministrantų ir vadovų ugdymo, piligrimystės, bažnytinių vaikų ir jaunimo chorų, sporto “Judėk. Tikėk. Tobulėk”, Taize pasiruošimo, prevencinė programa “Sniego gniūžtė”. Projketus remia: Vilkaviškio vyskupijos Kurija, Vokietijos katalikų solidarumo akcija vidurio ir rytų Europai “RENOVABIS”, Amerikos Lietuvių Katalikų Religinė Šalpa, Marijampolės savivaldybė ir privatūs aukotojai. Organizuojame gavėnios ir advento seminarus, prisidedame prie Lietuvos Jaunimo Dienų organizavimo, dalyvaujame Lietuvos Pastoracinės Tarybos prie vyskupų konferencijos veikloje.